Innymi słowy, nieobrobione teoretyczne modelowanie historii populacji ludzi sugeruje, że warianty, które mają wysoką częstość populacji jako całość, i które prawdopodobnie będą odpowiedzialne za złożone cechy (powszechna choroba – powszechna hipoteza wariantu), będą na ogół bardzo stare, a zatem towarzyszy temu raczej niewielka nierównowaga sprzężeń (90). Ilościowo może to przekładać się na dziesiątki regionów genowych, z których każdy ma czynnik ryzyka mniejszy niż 1,1 x 1,4, ale które razem prowadzą do dużego ryzyka rozwoju choroby. Można postulować, że wraz z pojawieniem się populacji w Afryce od 30 000 do 50 000 lat temu, ekspozycja na nowe drobnoustroje spowodowała, że są to główne wąskie gardła w populacji, z przetrwaniem osobników z wariantami allelicznymi umożliwiającymi odporność na nowe zakaźne zdarzenie. Te kombinacje różnych genów zapewniających oporność na populację, gdy przypadkowo się łączą, skutkują nadreaktywnym układem odpornościowym, z kolejnymi chorobami autoimmunologicznymi, ceną, jaką dana osoba może zapłacić za ochronę ogólnej populacji. Specyfika narządu mogła pojawiać się, ponieważ każdy czynnik zakaźny ewoluował wraz z wąskim gardłem populacji, wybierając jeden. MHC ograniczający. element i kolejna specyficzność antygenu. Identyfikacja powszechnych wariantów allelicznych, które mogą leżeć u podstaw takich pospolitych chorób, wymaga innego podejścia niż badania powiązań. Jedną z metod może być faktyczna sekwencjonowanie całego genomu w grupie 5000 pacjentów ze stwardnieniem rozsianym w porównaniu z taką samą liczbą zdrowych kontroli. Chociaż byłoby to najbardziej wrażliwe podejście, ponieważ wszystkie warianty zostałyby zidentyfikowane, na tym etapie technologii nie byłoby nawet możliwe do rozważenia. Można argumentować, że ponieważ wydaje się, że w populacji występuje tylko około 10 milionów wariantów, polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP), moglibyśmy po prostu zbadać te z pacjentów z chorobą w porównaniu z osobnikami kontrolnymi. Byłoby to również znacznie wykraczające poza obecne technologie. Ewentualne powstające rozwiązanie jest zarówno eleganckie, jak i proste i opiera się na niedawnej obserwacji, która została faktycznie zasugerowana przez badania regionu MHC ponad dekadę temu. Odkrycie polega na tym, że warianty genetyczne występują wspólnie w tak zwanych. Blokach haplotypów .. To znaczy, ostatnie badania (91) wykazały, że rekombinacja nie jest równomiernie rozmieszczona wzdłuż chromosomów, jak wcześniej zakładano, ale raczej koncentruje się w gorących miejscach, które są przeciętnie oddalone od siebie o 20 do 40 kb (bloki haplotypów). Wykazano również, że u tych Europejczyków i Amerykanów pochodzenia europejskiego występuje bardzo mała różnorodność haplotypów w obrębie genomowych bloków haplotypowych (92). Ponownie, ta rozległa nierównowaga powiązań jest najprawdopodobniej konsekwencją poważnego wąskiego gardła populacji dotykającego Europejczyków od 30 000 do 50 000 lat temu (93). Populacja europejska jest zatem idealna do badań przesiewowych pod kątem powiązania wariantów allelicznych z chorobą, ponieważ bardzo niewiele markerów SNP z każdego z tych bloków nierównowagi wiązań będzie wymagane do przeszukiwania całego genomu (94). Oczekuje się, że będzie około 100 000 takich bloków haplotypów. Zakładając, że trzy SNP są wymagane do pełnego zbadania różnorodności haplotypów związanych z każdym blokiem, cały genom mógłby być przeszukiwany przy użyciu około 300 000 SNP (. 10% wszystkich SNP). To podejście zostało wykorzystane przez Rioux, Daly ego, Landera i współpracowników w celu zidentyfikowania locus IBD5 w poprzednio zidentyfikowanym piku połączeń u pacjentów z chorobą zapalną jelit (95). Skanowanie całego skojarzenia genomu, choć atrakcyjne, dopiero zaczyna być możliwe, ponieważ koszty genotypowania wciąż maleją. Możliwe jest również, że takie podejście może się nie udać, ponieważ stwardnienie rozsiane może być wynikiem więcej niż jednego zespołu genetycznego, który ogólnie uważa się za lub setki lub nawet tysiące genów, z których każdy reprezentuje tylko ułamkowy czynnik ryzyka, są powiązane z występowanie MS. Efekty epistatyczne genów również komplikują analizę. Niemniej jednak duże, odpowiednio zasilane eksperymenty ostatecznie odpowiedzą na pytanie dotyczące różnorodności chorób i względnych czynników ryzyka oraz zapobiegną marnowaniu zasobów na nieskuteczne badania, które mogą nie dać ostatecznych odpowiedzi. Powstawanie międzynarodowych konsorcjów, które umożliwiają znaczące zbiory pacjentów, w połączeniu z wysokoprzepustowym genotypowaniem, będzie miało kluczowe znaczenie przy wykonywaniu skanów całego genomu na podstawie mapy haplotypów. Te wspólne wysiłki, chociaż wykorzystują wiele zasobów, będą niezbędne do stworzenia prawdziwej mapy drogowej do racjonalnego odkrywania leków. Pod tym względem międzynarodowe konsorcjum genetyczne zostało utworzone dwa lata temu przez instytucje na całym świecie, w tym University of Cambridge, University of California w San Francisco, Duke University, Vanderbilt University, Harvard Medical School, Massachusetts Institute of Technology oraz Szpital Brighama i Kobiety
[patrz też: ziaja krem liście manuka, badanie kału na pasożyty, powiększone serce przyczyny ]
[podobne: powiększone serce przyczyny, dantis, dokumenty synonim ]
